El Museo de Sitio de la Secretaría de Educación Pública se encuentra ubicado en el edificio sede de la SEP, a un lado del mural de Diego Rivera llamado La entrada a la mina. Este espacio surge con el propósito de exhibir los objetos y vestigios del pasado, descubiertos en los años de 1989 a 1991 durante los trabajos de restauración a los inmuebles que conforman el conjunto arquitectónico.